Biobanca di Ricerca per la Medicina Personalizzata

Gli uffici, i laboratori e la sala criogenica della Biobanca sono collocati al secondo piano ala L/M della Fondazione Policlinico Universitario A. Gemelli IRCCS. Le 2 sale criogeniche ospitano contenitori alimentati da azoto liquido (Tank) e frigoriferi meccanici comprensivi di sistemi di backup di LN2 (linea di azoto), ove previsto:

• Area principale della Biobanca ospitante n°9 tank in vapori di azoto (-196°C; -80°C) e 4 frigoriferi meccanici (+4°C; -20°C; -80°C)
• “Disaster recovery”, collegata ad un serbatoio esterno distinto da quello della biobanca e avente 16 utenze destinate all’allaccio di altrettanti tank o frigoriferi meccanici

La sala criogenica è gestita da sistemi di monitoraggio e controllo operativo attivi 24h anche da remoto e sistemi di back-up. Tutte le attività di biobanking sono gestite tramite un sistema gestionale che garantisce la tracciabilità dei campioni. La struttura è adiacente alla facility di Preanalitica a e Biologia Cellulare di GSTeP (https://gstep.policlinicogemelli.it/#/) che viene adoperata per il processamento dei campioni biologici destinati alla Biobanca i cui laboratori sono equipeggiati per analisi preanalitiche, colture cellulari e procedure di biologia molecolare (livello di Biosicurezza BSL2).

La disponibilità di campioni biologici e dati clinici associati è una risorsa preziosa nell’ambito della medicina personalizzata per l’identificazione, validazione ed implementazione di marcatori clinici, strumentali o biologici oltre che per valutare l’efficacia e la sostenibilità dei trattamenti terapeutici ed il loro impatto sulla qualità di vita dei soggetti affetti.

La rilevanza di alcune patologie e la numerosità dei casi clinici trattati presso la Fondazione permettono di creare importanti raccolte di campioni biologici e dati clinici associati in Biobanca che verranno resi disponibile per il mondo della ricerca. 

I campioni biologici ed i dati clinici associati appartenenti alle raccolte della Biobanca vengono sottoposti a controlli di qualità.

Raccolte in Ginecologia Oncologica

La raccolta comprende campioni biologi e dati di pazienti con

1. Carcinoma Ovarico
2. Carcinoma dell’endometrio e dell’utero
3. Carcinoma della cervice
4. Carcinoma della vulva
5. Endometriosi

I campioni raccolti sono classificati secondo le seguenti coorti:

• Stadio precoce
• Stadi avanzati
• Pazienti sottoposte ad immunoterapia
• Pazienti sottoposte a chemioterapia
• Recidive
• Tumori rari

Circa l’85% delle pazienti k-ovaio e k-endometrio, che affidano i campioni alla Biobanca FPG sono anche profilati per un pannello a 500 geni (FPG) per ricercare mutazioni a livello tumorale con valore diagnostico, prognostico e predittivo di risposta ai farmaci.

Tipologia del materiale conservato:

• Tessuto in OCT -> verifica della % della cellule tumorali
• PBMC -> aliquote da 2/3 milioni di cellule
• Siero -> aliquote da 500 microlitri
• Sangue Intero -> aliquote da 1 ml
• Plasma per ctDNA -> aliquote da 2ml

Raccolta campioni COVID

Tipologia del materiale conservato:

• Plasma -> aliquote da 500 microlitri
• Siero -> aliquote da 500 microlitri
• Sangue intero -> aliquote da 500 microlitri
• Urine -> aliquote da 500 microlitri

Raccolta Dermatologia – melanoma e tumori cutanei

Tipologia del materiale conservato:

• Tessuto fresco di biopsie cutanee in RNA later in OCT
• Sangue Intero -> aliquote da 6ml
• Sangue Intero in RNA later
• Plasma -> aliquote da 1.5 ml  
• Siero -> aliquote da 1.5 ml 

Raccolta IBD MALATTIE INFIAMMATORIE CRONICHE INTESTINALI

Tipologia del materiale conservato:

• Sangue -> aliquote da 500 microlitri
• Plasma -> aliquote da 500 microlitri
• Siero -> aliquote da 500 microlitri
• Feci -> aliquote in eppendorf da 5ml
• Urine -> aliquote da 10 ml
• Campioni bioptici o chirurgici freschi -> aliquote in cryovial da 2ml

I campioni raccolti sono classificati secondo le seguenti 5 coorti:

• COORTE I (THERAPY STARTING): Pazienti che iniziano terapia con farmaci biologici e/o small molecules e relativi follow up
• COORTE II (THERAPY LONG TERM RESPONDERS): Pazienti in terapia stabile e clinicamente responder da almeno 1 anno farmaci biologici e/o small molecules e relativi follow up
• COORTE III (THERAPY NON RESPONDERS): Pazienti non responder a ciclo completo di terapia con farmaci biologici e/o small molecules 
• COORTE IV (NAIVE): Pazienti naive a farmaci biologici o small molecules, in terapia con farmaci “convenzionali” e relativi follow up 
• COORTE V (SURGERY PATIENTS): Pazienti sottoposti ad interventi chirurgici per malattia IBD.

Raccolta Senologia Oncologica

Tipologia del materiale conservato:

• Tessuto in OCT
• PBMC -> aliquote da 2/3 milioni di cellule
• Siero -> aliquote da 500 microlitri

Biobanca Nazionale SLA- AISLA

AISLA Onlus ha avviato Ia creazione di una Biobanca Nazionale, in grado di raccogliere e custodire centinaia di migliaia di campioni biologici, provenienti da pazienti affetti da Sclerosi Laterale Amiotrofica, arruolati da quanti più centri possibili, coinvolti nella ricerca clinica sulla SLA. In Fondazione la raccolta dei campioni biologici conservati presso la Biobanca FPG e dei dati clinici associati è stata attivata dal Prof. Mario Sabatelli.

Tipologia del materiale conservato: 

• NHDF (Normal Human Dermal Fibroblasts ) -> aliquote da 200’000/500’000 cellule
• iPSC (Induced Pluripotent Stem Cells) -> aliquote da 1/2 milioni di cellule 

I campioni raccolti hanno le seguenti caratteristiche:

I campioni NHDF sono comprensivi di informazioni riguardanti: il fenotipo, l’età e la sede di esordio, i risultati dei test genetici nei geni maggiormente associati a SLA (SOD1, TARDBP, FUS, C9orf72), la familiarità ed eventuale comorbidità con Demenza Fronto-Temporale.  

I campioni di iPSC sono stati derivati dalle cellule NHDF ottenute da pazienti mediante riprogrammazione con Sendai virus. Sono state testate per: staminalità, capacità di differenziamento, anomalie cromosomiche e per eventuali varianti genomiche nei geni maggiormente associati a SLA di cui il paziente di origine è portatore.